Cuaderno de prácticas biología molecular y citogenética - 3º trimestre.

OBJETIVO: Leer secuencias de ADN obtenidas a partir de secuenciación automática de ADN. MATERIALES: Diagrama de la secuencia Ordenador con acceso a internet PRACTICA: Anotamos la secuencia de nucleótidos: Línea 1: GNNNNNTGGNNNNNNNATANTTGCGGCCGCGGTTTTNTTTTTTTNTTNNNCNNGGAGCACAA NCNAATGNANTGTGTTGTTGTGGCGARGGC- GARGGCGCCGTTHHTAAAACTGTCTCCTGATATCCTACACAACAAACAAATTTCAT Línea 2: CGGAGTATGTACCGACTGTTTTTGACAACTATGCAGTCACAGTTATGATTGGTGGAGAACCAT ATACTCTTGGACTTTTTGATACTGCAGGGCAAGTTATGA- CAGATTACGACCGCTCACTTATCCACAAACAG Línea 3: ATGTATTTCTAGTCTGTTTTTCAGTGGTCTCTCCATCTTCATTTGAAAACGTGAAAGAAAAGTG GTGCCTGAGATAACTCACCACTGTCCAAGACNCCTTTCTT- GCTTGTTGGGACTCAAATTGATCTCAACGAGATGACCC Línea 4: CTCTACTATTGAGAAACTTGCCAAGAACAAACAGAAGCCTATCACTCCANAGACTGGGTGAAA AGCTGGCCCGTGACCTGAANGCNGTCAAAGTATGTG- GAGTGTTCTGCACTTACACAGCAGANGTCTGAAAAATGTGTTNATGAAGC Posteriormente, examinamos el informe de búsqueda BLASTN, identificamos un gen probable, y e...

OBJETIVO: Explorar la herramienta BLAST bioinformatics. MATERIALES: Una computadora con acceso a Internet. White Light Box (caja de luz blanca) Radiografías PRÁCTICA: Ejercicio 1: Primero comenzamos en la flecha y leemos hacia arriba el gel durante 20 nucleótidos. Escribimos la secuencia de ADN. Buscar la secuencia en la base de datos del NCBI utilizando el programa BLASTN. Y después comenzamos en la flecha y leemos hacia arriba el gel durante 30 nucleótidos. Escribir la secuencia de ADN. Buscar la secuencia en la base de datos del NCBI utilizando el programa BLASTN. Así lo que observamos es como aumenta el porcentaje de coincidencia de la secuencia con el resultado a. ¿Los resultados obtenidos con BLASTN para la primera y la segunda búsqueda se parecen entre sí? Las secuencias deberían ser casi idénticas para la primera y segunda búsqueda, pero los valores asociados a cada hit son más altos para la segunda búsqueda. b. ¿Cuál e...

OBJETIVO: -Desarrollar el conocimiento de las técnicas de hibridación. MATERIALES: Aparato de electroforesis horizontal  Fuente de energía para la electroforesis.  Sistema de visualización del ADN  Bandeja para la tinción. Baño de agua. Estufa o incubador 80ºC (OPCIONAL). Micropipetas automáticas y puntas.  Microtubos y tubos de 10 ml.  Placa calefactora o microondas. Agua destilada  NaCl.  NaOH  HCl concentrado. Plástico para envolver y papel secante. PRÁCTICA: Primero preparamos el gel  de agarosa al 0.8% para la electroforesis de las muestras lista para ser sembradas.Utilizamos un gel de 7 x 7 cm o 7 x 10 cm. Con 6 pocillos con una capacidad de 40 ul.  Antes de la siembra de las muestras en un baño de agua a 65ºC para calentamos las muestras que contiene el ADN  durante 2 minutos y dejamos enfriar las muestras otros 2 minutos. Posteriormente sembramos las muestras A-E en pocillos consecutivos. ...