Práctica 4- Secuenciación automática del genoma humano.

OBJETIVO:

Leer secuencias de ADN obtenidas a partir de secuenciación automática de ADN.

Anotamos la secuencia de nucleótidos:

Línea 1:

GNNNNNTGGNNNNNNNATANTTGCGGCCGCGGTTTTNTTTTTTTNTTNNNCNNGGAGCACAA

NCNAATGNANTGTGTTGTTGTGGCGARGGC-

GARGGCGCCGTTHHTAAAACTGTCTCCTGATATCCTACACAACAAACAAATTTCAT

Línea 2:

CGGAGTATGTACCGACTGTTTTTGACAACTATGCAGTCACAGTTATGATTGGTGGAGAACCAT

ATACTCTTGGACTTTTTGATACTGCAGGGCAAGTTATGA-

CAGATTACGACCGCTCACTTATCCACAAACAG

Línea 3:

ATGTATTTCTAGTCTGTTTTTCAGTGGTCTCTCCATCTTCATTTGAAAACGTGAAAGAAAAGTG

GTGCCTGAGATAACTCACCACTGTCCAAGACNCCTTTCTT-

GCTTGTTGGGACTCAAATTGATCTCAACGAGATGACCC

Línea 4:

CTCTACTATTGAGAAACTTGCCAAGAACAAACAGAAGCCTATCACTCCANAGACTGGGTGAAA

AGCTGGCCCGTGACCTGAANGCNGTCAAAGTATGTG-

GAGTGTTCTGCACTTACACAGCAGANGTCTGAAAAATGTGTTNATGAAGC

Posteriormente, examinamos el informe de búsqueda BLASTN, identificamos un gen probable, y

examinar la identificación de genes para obtener información detallada:

Ciclo de división celular 42 (proteína de unión a GTP) o CDC42

La CDC42 es una molécula reguladora intracelular clave que está implicada en la

forma de la célula. En células de mamíferos, la proteína CDC42 regula el citoesqueleto

de actina (el andamiaje de una célula) para producir una estructura filamentosa

llamada filopodio, que están implicadas en la detección de otras células y el

movimiento celular. Las mutaciones en CDC42 y sus proteínas asociadas se

correlacionan con ciertos tipos de cáncer.